对于如何建立和巩固新政权，似乎对于政变者来说还未做好充分准备。新政府中，在权力分配方面出现了争执，使新的政府领导人和内阁人选迟迟没有任命。直到3月28日，革命司令部全国委员会才正式宣布，任命阿拉伯复兴党人萨拉姆丁·比塔尔为总理和组织新政府。比塔尔，阿拉伯复兴党创始人之一，曾任总书记，是叙利亚的政治元老，曾多次参加政府工作，他曾从泛阿拉伯主义立场出发，赞同叙利亚与埃及合并，后鉴于埃及人对叙利亚的控制，转向反对叙、埃合并，辞去政府职务。阿塔西任总统和比塔尔任总理，预示着必将出现阿拉伯复兴党与少壮派军人集团的政见分歧，从而导致政治危机。
统一激情再度高涨
叙利亚的纳赛尔分子，始终主张恢复阿拉伯联合共和国，重新实行叙利亚与埃及的合并。“三八”政变的胜利，再一次鼓舞了他们的政治信念。在大马士革和不少城市欢呼政变胜利的群众示威游行或集会中，高呼“纳赛尔！纳赛尔！”和“纳赛尔万岁！”
在这次政变的当天，埃及官方就宣布：埃及将在军事上支持夺取大马士革政权的叙利亚革命司令部全国委员会。